Mặc dù dịch vụ thanh toán Apple Pay được Apple giới thiệu cùng lần trong buổi sự kiện với các sản phẩm mới, nhưng mãi chờ cho đến tháng 10 Apple mới thương mại hoá chức năng thanh toán này.
Chức năng này sẽ hoạt động cùng với ứng dụng Passbook, nơi có thể lưu đến 8 thẻ tín dụng. Để thiết lập chức năng Apple Pay, bạn truy cập Passbook hoặc vào phần Passbook & Apple Pay trong Settings, từ đây bạn có thể dùng camera để scan để nhận diện thông tin thẻ, hoặc thêm thẻ đó thông qua tài khoản iTunes. Với phương thức thanh toán mới được Apple trang bị cho iPhone 6/6 Plus, người dùng sẽ dễ dàng giao dịch hơn trong quá trình mua sắm, với độ bảo mật và an toàn rất cao khi được kết hợp cùng chip Touch ID và NFC. Nếu chẳng may có sơ xuất gì trong quá trình thanh toán, ảnh chụp màn hình trong quá trình thanh toán có thể xác định được nguyên nhân và từ đó đối tác của Apple Pay sẽ giải quyết nhanh chóng vấn đề này cho khách hàng của mình.
Không những thế, tính năng này còn có rất nhiều ưu điểm bởi khả năng hiển thị thông tin khá chi tiết, ví dụ như nó sẽ liệt kê các giao dịch gần đây khi bạn mới vừa bổ sung thêm thẻ vào, tất nhiên là những giao dịch đó đều phải thực hiện qua Apple Pay. Không những thế, khi thẻ của bạn hết hạn, chức năng này sẽ tự động cập nhật và đưa ra một thẻ mới để thay thế.
Với tính bảo mật cao, thông tin về cá nhân bao gồm tên, email và 4 số cuối của thẻ sẽ không xuất hiện trên hoá đơn. Nó chỉ hiển thị 4 số cuối thông tin tài khoản của người dùng, đây là mã số riêng của khách hàng được Apple Pay cung cấp. Hiện chức năng này đã được khởi động tại một số cửa hàng bán lẻ ở thành phố Cupertino, California, trụ sở của Appe.