Sau khi download và cài đặt NoDupe, chạy chương trình bạn sẽ thấy hai thẻ Search và Results nằm bên trái giao diện trong khi các tiêu chuẩn tìm kiếm được bố trí ở bên phải. Để bắt đầu, bạn chọn một trong các thành phần cần tìm kiếm ở mục Search Type bao gồm Albums (album), All Files (tất cả tập tin), Directories (thư mục), Large Files (tập tin kích thước lớn) và Music Files (tập tin nhạc). Nhấn Customize để tuỳ chỉnh thêm bằng việc giới hạn Extension (đuôi mở rộng) và Size (kích thước) cho bộ lọc rồi nhấn Apply để phần mềm ghi nhận.
Ngoài ra, bạn có thể nhấn nút Options trong mục Advanced để truy cập cửa sổ Advanced Options nhằm cấu hình các thiết lập nâng cao trong việc xoá tập tin và ẩn thư mục. Nhấn Apply để trở về màn hình chính rồi nhấn Search để NoDupe bắt đầu rà soát toàn bộ ổ cứng để tìm kiếm.
Khi quá trình tìm kiếm kết thúc, ứng dụng sẽ tự động chuyển sang thẻ Results và hiển thị danh sách tất cả tập tin và thư mục trùng lặp đã tìm thấy trong máy tính.
Bạn có thể nhấn Auto Mark để sử dụng tuỳ chọn tự động đánh dấu tập tin trùng lặp theo thời gian, kích thước và đường dẫn.
Tất cả tập tin trùng lắp sẽ được đánh dấu theo cấu hình cá nhân của bạn trong phần Auto Mark và sẵn sàng để được bạn xoá bỏ triệt để bằng nút Delete phía dưới bên phải giao diện.
Với tốc độ làm việc nhanh chóng, khả năng tương thích hoàn toàn với Windows XP, Windows Vista và Windows 7 và thiết kế tiên phong trong việc tìm kiếm tập tin âm nhạc, album và thư mục, NoDupe là đối thủ đáng gờm của bất cứ phần mềm thương mại nào trong cùng lĩnh vực.