Không lâu sau khi Kindle Fire chính thức lên kệ, Amazon hôm 17/11/2011 đã bắt đầu phát hành mã nguồn của sản phẩm này đến cho các lập trình viên. Amazon mong muốn với mã nguồn được cung cấp, đội ngũ phát triển sẽ thấy hứng thú với sản phẩm Kindle Fire và sẽ đầu tư vào phát triển ứng dụng cho nó. Mặc dù phát hành miễn phí, nhưng mã nguồn của Kindle Fire vẫn phải chịu một số ràng buộc về bản quyền với hệ điều hành Android.
Amazon sử dụng Android 2.3 làm hệ điều hành cho Kindle Fire, song giao diện đã được tùy biến. Người dùng khi nhìn vào hầu như không còn thấy bóng dáng của giao diện Android gốc. Về ứng dụng, Amazon cũng có những quy định riêng, chỉ cho phép người dùng tải ứng dụng từ Amazon Appstore. Ngay cả gian ứng dụng chính của Android là Android Market cũng không được cài mặc định trên Kindle Fire, buộc người dùng phải root máy nếu muốn sử dụng. Việc cung cấp mã nguồn sẽ giúp cho các nhà phát triển có thể viết mới và chuyển đổi những ứng dụng hiện có từ Android gốc sang phiên bản Android của Kindle Fire dễ dàng hơn.
